TB-SMART? 助力結核病精準防控

全基因組測序技術已經廣泛應用于結核分枝桿菌的研究中，包括譜系鑒定、微進化、耐藥預測、傳播監測、混合感染診斷等多方面。生物信息學在基因組學研究中貫穿了從數據處理、分析到可視化的各個階段，對全基因組測序技術的應用起到了至關重要的作用。生物信息學分析軟件和平臺的開發為同領域研究者更方便、更靈活地開展數據分析和快速選擇研究分析工具提供參考。

我們在已有的結核分枝桿菌全基因組數據分析平臺的基礎上，整合了國家結核病管理信息系統導出的患者流行病學信息，開發了行業首個結核病耐藥和傳播監測平臺。該平臺為結核病預防和控制機構及時準確了解當地結核病耐藥和傳播情況，監測和預警結核病在人群中的傳播，為實現結核病的精準防控提供了強有力的技術支撐。

 

平臺功能展示

分析系統主頁

1. 患者和菌株數據庫

通過統一的患者和菌株信息管理，可查看每例患者的信息（總計、月度分析、年度分析等）和全基因組測序分析結果。

 

2. 全基因組數據分析

提供耐藥預測、數據統計、數據質控、變異信息、耐藥突變和分析報告。

總覽表

耐藥預測：預測17種常見結核藥物包含4種一線藥物的耐藥性和敏感性。

 

數據統計：堿基比例分布、測序質量分布、測序深度分布、變異檢測統計、堿基替換類型分布、 Indel 長度分布、插入片段長度分布。

 

3. 結核菌耐藥監測

分析結核菌耐藥類型，對進其行時間、空間、人群統計和可視化。

結核耐藥監測分布地圖

 

不同時間統計展示：可按年、月、周統計

 

人群分布統計展示：可按人群性別、年齡、民族等統計

 

 

4. 結核病傳播監測分析

快速判定患者是否由近期傳播導致發病并識別與其具有傳播關系的患者，同時展示這些患者的空間分布特征；統計不同人群的近期傳播率，識別近期傳播的高危人群。

分析結核菌菌株親緣關系及可視化

成簇表示樣本可以聚類在一起，提示樣本間存在傳播關系。一個點理論上代表一個樣本，但多個樣本地理坐標重疊的情況下會存在一個點對于多個樣本。

人群分析柱狀圖

可按性別、年齡、登記分類、職業、戶籍地址、耐藥類型、標簽、分型民族、 涂片結果、合并癥統計。統計不同人群的近期傳播率，識別近期傳播的高危人群。

 

5. 用戶分級管理保證數據安全

保證數據安全：可本地部署，用戶分級管理。

 

6. 關于軟件測評

分析系統安裝完成后主要需要測試的功能點：

1、準備內部已經分析過的樣本
2、樣本信息管理（創建單個樣本，編輯單個樣本，批量導入和刪除）
3、上傳數據（測試手動上傳數據，自動上傳需要部署后才能測試）
4、數據分析（啟動單個分析和批量啟動分析）
5、分析結果查看（選擇一個樣本對比內部系統的所有結果是否一致，報告是否正常生成和下載）
6、系統管理（增刪編輯用戶，權限管理）
7、恢復系統（刪除添加的樣本，數據和用戶）

 

電話：13392273325（微信）

Q Q：2775427010